『R&C超自然公司魔法攻击假说』
提出者：茵蒂克丝。
该假说认为，导致洛杉矶三千万人消失的直接原因是R&C超自然公司发动的大规模魔法攻击。
实际上已确认到一位利用沙子进行狙击的魔法师存在。其威力甚至能够切断钢筋混凝土。
不过就连作为魔道书图书馆的茵蒂克丝，也无法完全解析出对方具体使用了哪种魔法。
『学园都市毒气攻击假说』
提出者：欧提努斯。
该假说认为，洛杉矶市民的消失，是因为急功近利的学园都市方在市区使用了某种未知的化学武器，为了掩盖其留下的一切痕迹所造成的。在这种假说下，所有的尸体都已被回收完成，R&C超自然公司也已经被摧毁，学园都市方已经从污染区域内安全撤离。
『R&C超自然公司劫持无人兵器假说』
提出者：欧提努斯。
该假说认为，学园都市派来的无人兵器群以及军用数据链均被世界级大型IT企业——R&C超自然公司方劫持，联合部队因此遭受到学园都市无人兵器的攻击并全灭。在这种假说下，R&C超自然公司依然健在。
此外，该假说可与上述的毒气假说并存。
『密封防沙对策假说』
提出者：上条当麻。
该假说认为，使用管道胶带封闭门窗的缝隙是为了对抗沙之魔法。
上条一行受到了来自非英国清教=R&C超自然公司方的魔法师？利用沙子发动的大规模术式攻击。其威力能够切断建筑物及泳池，但在另一方面，神裂通过泼洒丹宁的术式证明了学园都市基地区域内「没有血迹」。
『R&C超自然公司多名魔法师假说』
提出者：史提尔·马格努斯。
该假说认为，R&C超自然公司为了保护本部大楼，除了沙之魔法师以外还投入了其他多名人员，并通过沙子以外的魔法导致了三千万人的消失。不过在现在的时间点，史提尔无法具体说明对方派出了多少人，使用了怎样的术式。
『密封防寒对策假说』
提出者：上条当麻。
该假说认为，封死门窗缝隙是为了不要让外界零下二十度的寒冷空气破坏室内暖气而采取的防寒对策。
关于洛杉矶市民消失的问题则没有提及。
『洛杉矶市民集体自杀假说』
提出者：欧提努斯。
由上述「密封防寒对策假说」衍生而来。该假说认为，为了防寒而堵塞了空气流通的洛杉矶市民，在密闭的室内享受由暖气加热的空气时因意外遭受一氧化碳中毒而丧生。
姑且说明了洛杉矶市民的死亡原因，但并没有提及尸体消失的问题。