『R&C超自然公司真犯人假说』
提出者：上条当麻。
该假说认为，可以在饲主与家犬的角色之间互相切换的球体关节人偶以及银发褐肤的美女全都是R&C超自然公司准备的假货。无论选择哪一方，如何采取行动，上条都将面临灾难。真正的梅尔莎白已经和其他三千万人一起被隐藏在了沙海之中。
在这种假说下，真正的梅尔莎白和三千万人的消失根本没有关系，完全是冤罪。
另外R&C超自然公司的目的是将冤罪一件件推给真正的梅尔莎白，直到让她在全世界均无容身之地，逼迫她成为CEO安娜·施普伦格尔的一具便利的傀儡。
推测梅尔莎白·格萝瑟利不想让自己亲自开发出来的物流黄蜂遭受恶用，于是计划假装顺从，借此潜入R&C超自然公司的本部大楼，利用自己研发的恶意软件破坏巨大的物流网络。虽然这个挑战还没开始就被阻止了，但梅尔莎白与其他从属于大型IT企业的职员和领导不同，其直到最后依然不放弃抵抗的姿态引起了安娜的兴趣。
高尚、清廉、纯洁，因此才想占有。
或许对于安娜来说，这就是一种与她作为恶党的身份格格不入，却又无法舍弃的渴望。
这个假说得到了欧提努斯、妹妹们以及总统罗伯特·卡崔等人的支持。
另外，史提尔·马格努斯通过其他方式确认了梅尔莎白读不懂德语的事实。
成功揭露魔法师奇特利尼塔斯和副总统达里斯·休雷因的黑幕身份。
是时候实现与啜泣少女之间的约定了。
之后只要打倒强敌就行。如此一来，等待着他们的必然会是Happy End。